Dieser sehr komplexe Vorgang in der Biologie wird von grünen Pflanzen durch das Blattgrün (Chlorophyll) in Gang gesetzt. Sehr einfach ausgedrückt ist es die Umwandlung von Kohlenstoffdioxid (CO2) in Sauerstoff (O) unter Sonnenlichteinfluss. Für den Sauerstoffhaushalt eines Gewässers sind daher grüne Unterwasserpflanzen von großer Bedeutung. Das Gegenteil der Assimilation ist die Dissimilation.